Διεύθυνση:

Μουσείο Φυσικής Ιστορίας Κρήτης, Πανεπιστήμιο Κρήτης,
Λεωφ. Κνωσσού,
GR714 09 Ηράκλειο, Κρήτη

Τμήμα:
Διοίκηση / Τεχνικό τμήμα
Εργαστήριο Μοριακής Συστηματικής και Εξέλιξης
Full CV:
PDF icon Πλήρες Βιογραφικο Σημείωμα
Psonis N., Lymberakis P., Poursanidis D., Poulakakis N. (2016) Contribution to the study of Acanthodactylus (Sauria: Lacertidae) mtDNA diversity focusing in the A. boskianus species group. Mitochondrion.
Psonis N., Antoniou A., Kukushkin V.O., Jablonski D., Petrov B., Crnobrnja – Isailović J., Sotiropoulos K., Gherghel I., Lymberakis P., Poulakakis N. (2016) Unexpected phylogenetic relationships within the Podarcis tauricus subgroup (Sauria, Lacertidae) using multilocus approaches. Molecular Phylogenetics and Evolution
Hedman H.D., Karameta E., Kapsalas G., Psonis N., Poulakakis N., Foufopoulos J., Pafilis P. (2016) A new locality record of Podarcis peloponnesiacus (Bibron and Bory, 1833) (Sauria: Lacertidae) from Athens, Greece.
Kapli P., Lymberakis P., Crochet P., Geniez P., Brito J.C., Almutairi M., Ahmadzadeh F., Schmitz A., Wilms T., Pouyani N.R., Poulakakis N. (2015) Historical biogeography of the lacertid lizard Mesalina in North Africa and the Middle East. Journal of Biogeography 42(2), 267-279. doi:10.1111/jbi.12420
Dritsou V., Deligianni E., Dialynas E., Allen J., Poulakakis N., Louis C., Lawson D., Topalis P. (2015) Non-coding RNA gene families in the genomes of anopheline mosquitoes. BMC Genomics 15, 1038
Psonis N., Lymberakis P., Poursanidis D., Poulakakis N. (2016) Contribution to the study of Acanthodactylus (Sauria: Lacertidae) mtDNA diversity focusing in the A. boskianus species group. Mitochondrion.
Psonis N., Antoniou A., Kukushkin V.O., Jablonski D., Petrov B., Crnobrnja – Isailović J., Sotiropoulos K., Gherghel I., Lymberakis P., Poulakakis N. (2016) Unexpected phylogenetic relationships within the Podarcis tauricus subgroup (Sauria, Lacertidae) using multilocus approaches. Molecular Phylogenetics and Evolution
Hedman H.D., Karameta E., Kapsalas G., Psonis N., Poulakakis N., Foufopoulos J., Pafilis P. (2016) A new locality record of Podarcis peloponnesiacus (Bibron and Bory, 1833) (Sauria: Lacertidae) from Athens, Greece.
Kapli P., Lymberakis P., Crochet P., Geniez P., Brito J.C., Almutairi M., Ahmadzadeh F., Schmitz A., Wilms T., Pouyani N.R., Poulakakis N. (2015) Historical biogeography of the lacertid lizard Mesalina in North Africa and the Middle East. Journal of Biogeography 42(2), 267-279. doi:10.1111/jbi.12420
Dritsou V., Deligianni E., Dialynas E., Allen J., Poulakakis N., Louis C., Lawson D., Topalis P. (2015) Non-coding RNA gene families in the genomes of anopheline mosquitoes. BMC Genomics 15, 1038
Psonis N., Vardinoyannis K., Mylonas M., Poulakakis N. (2015) Unraveling the evolutionary history of the Chilostoma Fitzinger, 1833 (Mollusca, Gastropoda, Pulmonata) lineages in Greece. Mol. Phyl. Evol. 91, 210-225, doi:10.1016/j.ympev.2015.05.019
Psonis N., Vardinoyannis K., Mylonas M., Poulakakis N. (2015) Evaluation of the taxonomy of Helix cincta (Muller, 1774) and Helix nucula (Mousson, 1854); insights using mitochondrial DNA sequence data. Journal of Natural History 49(5-8), 383-392, doi:10.1080/00222933.2013.825023
Poulakakis N., Edwards D.L., Chiari Y., Garrick R.C., Russello M.A., Benavides E., . . ., Caccone A. (2015) Description of a new Galapagos giant tortoise species (Chelonoidis; Testudines: Testudinidae) from Cerro Fatal on Santa Cruz island. PLOS One 10(10),e0138779, doi:10.1371/journal.pone.0138779
Candan K., Kankilic T., Guclu O., Kumlutaş Y., Durmus S.H., Lymberakis P., Poulakakis N., Çetin I. (2014) First Assessment on the Molecular Phylogeny of Anatololacerta (Squamata, Lacertidae) Distributed in Southern Anatolia; Insights From mtDNA and nDNA Markers. Mitochondrial DNA 1-8
Poulakakis Ν., Kapli P., Lymberakis P., Trichas A., Vardinoyiannis K., Sfenthourakis S., Mylonas M. (2014) A review of phylogeographic analyses of animal taxa from the Aegean and surrounding regions. Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research 53(1), 18-32
Poulakakis N., Kapli P., Lymberakis P., Trichas A., Vardinoyiannis K., Sfenthourakis S., Mylonas M. (2014) A review of phylogeographic analyses of animal taxa from the Aegean and surrounding regions. Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research 53(1),18-32, doi:10.1111/jzs.12071
Sagonas K., Poulakakis N., Lymberakis P., Parmakelis A., Pafilis P., Valakos E.D. (2014) Molecular systematics and historical biogeography of the green lizards (Lacerta) in Greece: Insights from mitochondrial and nuclear DNA. Mol. Phyl. Evol. 76, 144–154
Vogiatzi E., Kalogianni E., Zimmerman B., Giakoumi S., Barbieri R., Paschou P., Magoulas A., Tsaparis D., Poulakakis N., Tsigenopoulos C.S. (2014) Reduced genetic variation and strong genetic population structure in the freshwater killifish Valencia letourneuxi (Valenciidae) based on nuclear and mitochondrial markers. Biological Journal of the Linnean Society 111, 334–349
Vogiatzi E., Kalogianni E., Zimmerman B., Giakoumi S., Barbieri R., Paschou P., Magoulas A., Tsaparis D., Poulakakis N., Tsigenopoulos C.S. (2013) Reduced genetic variation and strong genetic population structure in the freshwater killifish Valencia letourneuxi (Valenciidae) based on nuclear and mitochondrial markers. Biol. J. linn. Soc. 111, 334–349, doi:10.1111/bij.12206
Poulakakis N., Kapli P., Kardamaki A., Skourtanioti E., Goecmen B., Ilgaz C., Kumlutaş Y., Avcı A., Lymberakis P. (2013) Comparative phylogeography of six herpetofauna species in Cyprus: late Miocene to Pleistocene colonization routes. Biological Journal of the Linnean Society 108(3), 619-635
Guclu O., Candan K., Kankilic T., Kumlutaş Y., Durmus S.H., Poulakakis N., Ilgaz C. (2013) Phylogeny of Trachylepis sp. (Reptilia) from Turkey inferred from mtDNA sequences. Mitochondrial DNA 0, 1-8
Kapli P., Botoni D., Ilgaz C., Kumlutaş Y., Avcı A., Pouyani N.R., Fathinia B., Lymberakis P., Ahmadzadeh F., Poulakakis N. (2013) Molecular phylogeny and historical biogeography of the Anatolian lizard Apathya (Squamata, Lacertidae). Mol. Phyl. Evol. 66, 992–1001
Kyriazi P., Kornilios P., Nagy Z.T., Poulakakis N., Kumlutaş Y., Ilgaz C., Avcı A., Göçmen B., Lymberakis P. (2013) Comparative phylogeography reveals distinct colonization patterns of Cretan snakes. Journal of Biogeography 40(6), 1143-1155
Kapli P., Botoni D., Ilgaz T., Kumlutaş Y., Avcı A., Rastegar-Pouyani N., . . ., Poulakakis N. (2013) Corrigendum to "molecular phylogeny and historical biogeography of the anatolian lizard Apathya (Squamata, lacertidae)" [mol. Phylogenet. Evol. 66 (2013) 992-1001]. Mol. Phyl. Evol. 69(1), 308-309
Garrick R.C., Benavides E., Russello M.A., Gibbs J.P., Poulakakis N., Dion K.B., Hyseni C., Kajdacsi B., Márquez L., Bahan S., Ciofi C., Tapia, W., Caccone, A. (2012) Genetic rediscovery of an ‘extinct’ Galápagos giant tortoise species. Current Biology 22(1), R10-R11
Poulakakis N., Russello M., Geist D., Caccone A. (2012) Unraveling the Peculiarities of Island Life: Vicariance, Dispersal and the Diversification of the Extinct and Extant Giant Galapagos Tortoises. Molecular Ecology 21, 160–173
Kyriazi P., Kornilios P., Nagy, T.N., Poulakakis N., Kumlutaş Y., Ilgaz C., Avcı A., Göçmen B., Lymberakis P. (2012) Comparative phylogeography reveals distinct colonization patterns of Cretan snakes. Journal of Biogeography doi:10.1111/jbi.12057
Deligianni E., Morgan R.N., Bertuccini L., Kooij T.W.A., Laforge A., Poulakakis N., Schüler H., Louis C., Matuschewski K., Siden-Kiamos I. (2011) Critical role for a stage-specific actin in male exflagellation of the malaria parasite. Cellular Microbiology 13(11), 1714–1730
Kapli P., Poulakakis N., Lymberakis P., Mylonas M. (2011) A re-analysis of the molecular phylogeny of Lacertidae with currently available data. Basic and Applied Herpetology 25, 97-104
Kornilios P., Kyriazi P., Poulakakis N., Kumlutaş Y., Ilgaz C., Mylonas M., Lymberakis P. (2010) Phylogeography of the ocellated skink Chalcides ocellatus (Squamata, Scincidae), with the use of mtDNA sequences: a hitchhiker's guide to the Mediterranean. Mol. Phyl. Evol. 54, 445-456
Lymberakis P., Poulakakis N. (2010) Three continents claiming an archipelago: The evolution of Aegean’s herpetofaunal diversity. Diversity 2, 233-255
Parmakelis A., Moustaka M., Poulakakis N., Louis C., Slotman M.A., Marshall J.C., Awono-Ambene P.H., Antonio-Nkondjio C., Simard F., Caccone A., Powell J.R. (2010) Anopheles immune genes and amino acid sites evolving under the effect of positive selection. PLOS One 5(1), e8885
Poulakakis N., Stamatakis A. (2010) Recapitulating the Evolution of Afrotheria: 57 genes and RGCs consolidate their history. Systematics and Biodiversity 8(3), 395–408
Russello M.R., Poulakakis N., Gibbs J.P., Tapia W., Powell J.R., Caccone A. (2010) DNA from the Past Informs Ex situ Conservation for the Future: An “Extinct” Species of Galapagos Tortoise Identified in Captivity. PLOS One 5(1), e8683
Pafilis P., Foufopoulos J., Poulakakis N., Lymberakis P., Valakos E. (2009) Tail shedding in island lizards (Lecertidae, Reptilia): Decline of antipredator defences in relaxed predation environments. Evolution 63(5), 1262–1278
Kornilios P., Poulakakis N., Mylonas M., Vardinoyannis K. (2009) Molecular phylogeny of the genus Zonites (Gastropoda: Pulmonata). Journal of Molluscan Studies 75(2), 109-117
Kapli P., Lymberakis P., Poulakakis N., Mantziou G., Parmakelis A., Mylonas M. (2008) Molecular phylogeny and evolutionary history of the species of the genus Mesalina (Sauria: Lacertidae) based on mitochondrial DNA sequences. Mol. Phyl. Evol. 49, 102–110
Poulakakis N., Antoniou A., Mantziou G., Parmakelis A., Skartsi Th., Vasilakis D., Elorriaga J., de la Puente J., Gavashelishvili A., Ghasabyan M., Katzner T., McGrady M., Batbayar N., Fuller M., Natsagdorj T. (2008) Population structure, diversity and phylogeography in the near threatened Eurasian Black Vulture Aegypius monachus (Falconiformes; Accipitridae) in Europe: insights from microsatellite and mtDNA variation. Biological Journal of the Linnean Society 95(4), 859-872
Kyriazi P., Poulakakis N., Parmakelis A., Crochet P.A., Moravec J., Rastegar-Pouyani N., Tsigenopoulos C.S., Magoulas A., Mylonas M., Lymberakis P. (2008) Mitochondrial DNA reveals the genealogical history of the snake-eyed lizards (Ophisops elegans and O. occidentalis) (Sauria: Lacertidae). Mol. Phyl. Evol. 49, 795-805
Poulakakis N., Glaberman S., Russello M., Beheregaray L.B., Ciofi C., Powell J.R., Caccone A. (2008) Rediscovery of an extinct species of giant Galapagos tortoise. PNAS 105(40), 15464–15469
Poulakakis N., Sfenthourakis S. (2008) Molecular phylogeny and phylogeography of the Greek populations of the genus Orthometopon (Isopoda, Oniscidea) based on mtDNA sequences. Zoological Journal of Linnean Society 152, 707-715
Poulakakis N., Pakaki V., Mylonas M., Lymberakis P. (2008) Phylogeography of the Greek legless skink Ophiomorus punctatissimus (Sauria: Scincidae). The impact of the Mid-Aegean trench in its phylogeography. Mol. Phyl. Evol. 47, 396-402
Trichas A., Lagkis A., Triantis K., Poulakakis N., Chatzaki M. (2008) Biogeographic patterns of tenebrionid beetles (Coleoptera, Tenebrionidae) on four island groups in the south Aegean Sea. Journal of Natural History 42, 491-511
Lymberakis P., Poulakakis N., Kaliontzopoulou A., Valakos E., Mylonas M. (2008) Two new species of Podarcis (Squamata; Lacertidae) from Greece. Systematics and Biodiversity 6(3), 307–318
Xirouchakis S., Poulakakis N. (2008) Biometrics, sexual dimorphism and gender determination in an insular population of griffon vultures (Gyps fulvus). ARDEA 96, 1-10

Σελίδες

Curriculum Vitae

Καθηγητής

Διεύθυνση επικοινωνίας:

Τμήμα Βιολογίας και Μουσείο Φυσικής Ιστορίας Κρήτης Πανεπιστήμιο Κρήτης, Λ. Κνωσσού, Τ.Θ. 2208, Τ.Κ. 71409, Ηράκλειο, Κρήτης

Σπουδές

ΕΚΠΑΙΔΕΥΣΗ

  • 1997: ΠΤΥΧΙΟ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ (1993-1997), Τμήμα Βιολογίας, Σχολή Θετικών Επιστημών, Πανεπιστήμιο Κρήτης.
  • 2000: Μεταπτυχιακός Τίτλος Ειδίκευσης (1997-2000), Τμήμα Γεωλογίας, Πανεπιστήμιο Αθηνών. Ειδίκευση: Ιστορική Παλαιοντολογία - Στρωματογραφία. Τίτλος ειδίκευσης: «Διερεύνηση δεσοξυριβονουκλεϊκών οξέων (DNA) σε οστά απολιθωμένων νάνων ελεφάντων από τη νήσο Τήλο Δωδεκανήσου και εφαρμογές αυτού στην ταξινόμηση.» Επίβλεψη Καθ. Γ. Θεοδώρου (Παν/μιο Αθηνών) και Καθ. Ε. Ζούρος (Παν/μιο Κρήτης).
  • 2005: ΔΙΔΑΚΤΟΡΙΚΗ ΔΙΑΤΡΙΒΗ (2002-2005), Τμήμα Βιολογίας, Πανεπιστήμιο Κρήτης. Γνωστικό αντικείμενο: Διαχείριση Χερσαίων και Θαλάσσιων Βιολογικών Πόρων. Τίτλος διατριβής: «Διερεύνηση των φυλογενετικών διεργασιών στις σαύρες του γένους Podarcis (Sauria: Lacertidae) του ελληνικού χώρου». Επίβλεψη: Καθ. Ε. Ζούρος.

ΑΚΑΔΗΜΑΪΚΗ ΑΠΑΣΧΟΛΗΣΗ

  • 2005-2006: Μεταδιδάκτορας Ερευνητής στο εργαστήριο Μοριακής Συστηματικής και Εξέλιξης (MSL) του Μουσείου Φυσικής Ιστορίας (ΜΦΙΚ) του Παν/μιου Κρήτης.
  • 2006-2007: Διδάσκων με σύμβαση ορισμένου χρόνου (ΠΔ 407/80), Τμήμα Βιολογίας, Παν/μιο Κρήτης.
  • 2007-2008: Μεταδιδάκτορας Ερευνητής στο εργαστήριο Μοριακής Συστηματικής και Γενετικής Διαχείρισης του τμήματος Οικολογίας και Εξέλιξης του Παν/μιου του YALE.
  • 2008-2009: Επιστημονικός Συνεργάτης του εργαστηρίου Μοριακής Συστηματικής και Γενετικής Διαχείρισης του τμήματος Οικολογίας και Εξέλιξης του Παν/μιου του YALE.
  • 2009 - 2015: Επίκουρος Καθηγητής Συστηματικής Ζωολογίας στο Τμήμα Βιολογίας του Πανεπιστημίου Κρήτης.
  • 2015 - 2020: Αναπληρωτής Καθηγητής Συστηματικής Ζωολογίας στο Τμήμα Βιολογίας του Πανεπιστημίου Κρήτης.
  • 2020 - σήμερα: Καθηγητής Συστηματικής Ζωολογίας στο Τμήμα Βιολογίας του Πανεπιστημίου Κρήτης.
  • 2018 - σήμερα: Διευθυντής Μουσείου Φυσικής Ιστορίας Κρήτης - Πανεπιστήμιο Κρήτης
  • 2021 - σήμερα: Συνεργαζόμενο μέλος ΔΕΠ στο Ινστιτούτο Μοριακής Βιολογίας και Βιοτεχνολογίας του ΙΤΕ (group Leader in ancient DNA lab)

Ερευνητικά ενδιαφέροντα

Τα ερευνητικά μου ενδιαφέροντα εστιάζονται στον ευρύτερο τομέα της συστηματικής, της μοριακής εξέλιξης, της φυλογένεσης, της φυλογεωγραφίας και της διαχείρισης και προστασίας ζωικών οργανισμών με τη χρήση κυρίως γενετικών δεδομένων. Ερευνητικά καθοδηγούμε βάσει ερωτημάτων, που σχετίζονται με α) την εκτίμηση της βιοιποικιλότητας και την ανάπτυξη νέων μεθόδων καθορισμού αυτής, β) τον έλεγχο της συστηματικής κατάστασης διαφόρων ειδών (σύγχρονων και απολιθωμένων), γ) τη διερεύνηση των φυλογενετικών τους σχέσεων και των φυλογεωγραφικών τους προτύπων, δ) την διερεύνηση της πληθυσμιακής κατάστασης κινδυνεύοντων ειδών και ε) την κατανόηση των μικρο-εξελικτικών διαδικασιών (ειδογένεση, προσαρμογή) σε απομονωμένους (νησιωτικούς) πληθυσμούς. Για το λόγο αυτό έχω ασχοληθεί με τη μελέτη μιας μεγάλης ποικιλίας ασπόνδυλων και σπονδυλωτών οργανισμών, όπως μαλάκια (χερσαία γαστερόποδα), ισόποδα, αμφίβια, ερπετά (χελώνες, σαύρες, φίδια), πτηνά (κυρίως αρπακτικά είδη), θηλαστικά (σύγχρονα και απολιθωμένα).

Πρόσφατες δημοσιεύσεις

  1. Sagonas, K., Karameta, E., Kotsakiozi, P., Poulakakis, N. 2019 Cross-species testing of nuclear markers in Pelophylax water frogs in Greece and examine their power for identifying hybrid populations. Amphibia - Reptilia 41: 253-259. DOI:10.1163/15685381-20191229.
  2. Τrichas, Α., Smirli, M., Papadopoulou, A., Anastasiou, I., Keskin, B., Poulakakis, N. 2020. Dispersal vs. vicariance in the Aegean: Combining molecular and morphological phylogenies of the eastern Mediterranean Dendarus (Coleoptera, Tenebrionidae) shed new light in the phylogeography of the Aegean area. Zoological Journal of Linnean Society 190 (3), 824–843. https://doi.org/10.1093/zoolinnean/zlaa022
  3. Poulakakis, N., Miller, J.M., Jensen, E.L., Beheregaray, L.B., Russello, M.A., Glaberman, S., Boore, J. Caccone, A. 2020. Colonization history of Galapagos giant tortoises: insights from mitogenomes support the progression rule. Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research 58, 1262–1275. https://doi.org/10.1111/jzs.12387.
  4. Psonis, N., de Carvalho, C.N., Figueiredo, S., Tampakaki, E., Vassou, D., Poulakakis, N., & Kafetzopoulos, D. 2020. Molecular identification, phylogenetic placement and geographic origin of a post-Medieval dental elephant finding from southwestern Portugal using a high-throughput sequencing approach. Scientific Reports 10:19252. https://doi.org/10.1038/s41598-020-75323-y.
  5. Jablonski, D., Gkontas, I., Poursanidis, D., Lymberakis, P., Poulakakis, N., 2021.Stability in the Balkans: phylogeography of the endemic Greek stream frog. Biological Journal of Linnean Society 132(4), 829-846.
  6. Strachinis, I.*, Poulakakis, N.*, Karaiskou, K., Patronidis, P., Patramanis, I., Poursanidis, D., Jablonski, D., and Triantafyllidis, A. 2021. Phylogeography and systematics of Algyroides (Sauria: Lacertidae) of the Balkan Peninsula. Zoological scripta 50, 282–299.
  7. Karakasi, D., Ilgaz, C., Kumlutaş, Y., Candan, K., Güçlü, O., Kankılıç, T., Beşer, N., Sindaco, R., Lymberakis, P., Poulakakis, N. 2021. More evidence of cryptic diversity in Anatololacerta species complex Arnold, Arribas and Carranza, 2007 (Squamata: Lacertidae) and re-evaluation of its current taxonomy. Amphibia-Reptilia 42(2), 201-216 (https://doi.org/10.1163/15685381-bja10045.)
  8. Avtzis, D.N., Markoudi, V. Mizerakis, V., Devalez, J., Nakas, G., Poulakakis, N., Petanidou, T. 2021 Divergence of Pygopleurus species in the Aegean Archipelago and the phylogeography of P. foina: evidence from the past. Systematics and Biodiversity (in press).
  9. Psonis, N., Antoniou, A., Karameta, E., Darriba, D., Stamatakis, A., Lymberakis, P. & Poulakakis, N. 2021. Phylogenomics and species delimitation of the Balkan wall lizards. Molecular Phylogenetics and Evolution 159, 107-121.