Skip to main content
search

Νίκος Πουλακάκης

Διευθυντής

Θέση Μέλος Δ.Ε.Π.
E-mail poulakakis@uoc.gr
Τηλ. +302810393619, +302810393282
Γραφείο Β210 (Λευκά Κτήρια, Πανεπιστημιούπολη Κνωσού)

Ερευνητικά ενδιαφέροντα

Μοριακή συστηματική, Φυλογένεση, Φυλογεωγραφία, Πληθυσμιακή Γενετική / Γενωμική αρτίγονων και εξαφανισμένων οργανισμών

Εκπαίδευση

  • 2005: Διδακτορική διατριβή (2002-2005), Τμήμα Βιολογίας, Πανεπιστήμιο Κρήτης. Γνωστικό αντικείμενο: Διαχείριση Χερσαίων και Θαλάσσιων Βιολογικών Πόρων. Τίτλος διατριβής: «Διερεύνηση των φυλογενετικών διεργασιών στις σαύρες του γένους Podarcis (Sauria: Lacertidae) του ελληνικού χώρου». Επίβλεψη: Καθ. Ε. Ζούρος.
  • 2000: Μεταπτυχιακός Τίτλος Ειδίκευσης (1997-2000), Τμήμα Γεωλογίας, Πανεπιστήμιο Αθηνών. Ειδίκευση: Ιστορική Παλαιοντολογία – Στρωματογραφία. Τίτλος ειδίκευσης: «Διερεύνηση δεσοξυριβονουκλεϊκών οξέων (DNA) σε οστά απολιθωμένων νάνων ελεφάντων από τη νήσο Τήλο Δωδεκανήσου και εφαρμογές αυτού στην ταξινόμηση.» Επίβλεψη Καθ. Γ. Θεοδώρου (Παν/μιο Αθηνών) και Καθ. Ε. Ζούρος (Παν/μιο Κρήτης).
  • 1997: Πτυχίο Βιολογίας (1993-1997), Τμήμα Βιολογίας, Σχολή Θετικών Επιστημών, Πανεπιστήμιο Κρήτης.

Πρόσφατες Δημοσιεύσεις

Filter

2025_Whole-genome sequencing confirms multiple species of Galapagos giant

Gaughran, S.J., Gray, R., Menna Jones, M., Fusco, N., Ochoa, A., Miller, J.M., Poulakakis, N., de Queiroz, K., Caccone, A., Jensen, E.L. (2025) Whole-genome sequencing confirms multiple species of Galapagos giant tortoises. Evolution Letters, 79(2), 296–308.

2025_Unravelling the thread of Podarcis omics; insights into the genome and transcriptome of the Cretan wall lizard.

Stratakis, M., Ioannidis, P., Bista, Ι., Absolon, D., Eagles, W., McCarthy, S., Denton, A., Lymberakis, P., Poulakakis, N. (2025) Unravelling the thread of Podarcis omics; insights into the genome and transcriptome of the Cretan wall lizard. Genes & Genomics,

2025_Read Length Dominates Phylogenetic Placement Accuracy of Ancient DNA Reads

Bettisworth, B., Psonis, N., Poulakakis, N., Pavlidis, P., Stamatakis, A. (2025) Read Length Dominates Phylogenetic Placement Accuracy of Ancient DNA Reads. Molecular Biology and Evolution, 42(2), 1-10.

2025_Podarcis siculus (Rafinesque, 1810) as a modern Lernaean Hydra: the emergence of a new invasive population in Crete

Pantagaki, C.F., Spaneli, V., Fisher, R.N., Alexandrakis, G., Poulakakis, N., Lymberakis, P. (2025) Podarcis siculus (Rafinesque, 1810) as a modern Lernaean Hydra: the emergence of a new invasive population in Crete and its implications for bridgehead invasions in the Greek Islands. Herpetology Notes, 18, 389-397.

2025_ERGA-BGE reference genome of Hanak’s bat Pipistrellus

Georgakakis, P., Karakasi, D., Lymberakis, P., Papadimitrakis, M., Stratakis, M., Bitzilekis, E., Poulakakis, N., Böhne, A., Monteiro. R., Fernández, R., Escudero, N., Genoscope Sequencing Team, Moussy. A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Mangenot, S., Belser, C., Wincker, P., Oliveira, P.H., Aury, J.-M., Haggerty, L., Sinha, S., Martin, F., Bortoluzzi, C. (2025) ERGA-BGE reference genome of Hanak's bat (Pipistrellus hanaki), an IUCN Vulnerable species restricted to forest-like biotopes. Open Res Europe, 5:298.

Σύντομο Βιογραφικό

Ο Νίκος Πουλακάκης είναι Καθηγητής του τμήματος Βιολογίας, διευθυντής του Μουσείου Φυσικής Ιστορίας Κρήτης του Πανεπιστημίου Κρήτης και συνεργαζόμενο μέλος ΔΕΠ του ΙΜΒΒ-ΙΤΕ (υπεύθυνος της ομάδας Παλαιογενωμικής και Εξελικτική Γενετικής – αρχαίο DNA). Σπούδασε Βιολογία (1997) στο Πανεπιστήμιο Κρήτης, απέκτησε μεταπτυχιακό τίτλο ειδίκευσης (2000) από το τμήμα Γεωλογίας του ΕΚΠΑ και διδακτορικό (2005) από το τμήμα Βιολογίας του Πανεπιστημίου Κρήτης. Εργάστηκε ως μεταδιδάκτορας ερευνητής από το 2006 έως το 2009 στο Μουσείο Φυσικής Ιστορίας Κρήτης (2006-2007) και στο τμήμα Οικολογίας και Εξέλιξης του Yale University (2007-2009).

Τα ερευνητικά του ενδιαφέροντα εστιάζονται στη μοριακή συστηματική, φυλογένεση, φυλογεωγραφία, πληθυσμιακή γενετική και τη διαχείριση ζωικών κυρίως οργανισμών, σύγχρονων και εξαφανισμένων. Έχει δημοσιεύσει 95 επιστημονικές εργασίες σε περιοδικά με συντελεστή απήχησης (3 ακόμα είναι υπό έλεγχο προς δημοσίευση), 3 βιβλία ή κεφάλαια σε βιβλία, ενώ παράλληλα έχει συμμετάσχει στην μετάφραση 6 εξελικτικών/οικολογικών βιβλίων. Έχει λάβει μέρος σε 28 εθνικά και διεθνή συνέδρια με 102 ανακοινώσεις (προφορικές και αναρτημένες), ενώ έχει συμμετάσχει σε περισσότερα από 30 ερευνητικά έργα (> 4 εκ. €), σε 18 από τα οποία ως ΕΥ ή υπεύθυνος πακέτου εργασίας (> 1εκ. €).

Έχει επιβλέψει 54 πτυχιακές εργασίες προπτυχιακών φοιτητών (4 σε εξέλιξη), 22 διπλωματικές εργασίες μεταπτυχιακών φοιτητών (2 σε εξέλιξη), 14 διπλωματικές εργασίες μεταπτυχιακών φοιτητών ως μέλος της εξεταστικής επιτροπής, 10 διδακτορικές διατριβές (7 σε εξέλιξη). Έχει συμμετάσχει σε 14 τριμελής συμβουλευτικές επιτροπές διδακτορικής διατριβής (8 σε εξέλιξη), σε 12 επταμελής εξεταστικές επιτροπές διδακτορικών διατριβών ενώ έχει επιβλέψει ή επιβλέπει 7 μεταδιδάκτορες ερευνητές. Είναι μέλος των συντακτικών επιτροπών επιστημονικών εργασιών του BMC Zoology και του Journal of Biological Research.

Παράλληλα έιναι μέλος των συντακτικών επιτροπών ερευνητικών έργων του FCT Biological Sciences Evaluation Panel (Portugal) και του Ελληνικού Ιδρύματος Έρευνας και Καινοτομίας (ΕΛΙΔΕΚ), καθώς  και κριτής σε πολυάριθμα επιστημονικά περιοδικά. Είναι μέλος διαφόρων εθνικών και διεθνών μη κερδοσκοπικών εταιρειών και ιδρυτικό μέλος της Ελληνικής Εξελικτικής Εταιρείας.

Bio CV

Filter

2024_SUB2d. Αναβάθμιση και εκσυγχρονισμός υποδομών

SUB2d. Αναβάθμιση και εκσυγχρονισμός υποδομών που σχετίζονται με τη βιοποικιλότητα/ Αναβάθμιση του Μουσείου Φυσικής Ιστορίας της Κρήτης.
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 2023 - 2025
Φορέας Χρηματοδότησης: Υπουργείο Περιβάλλοντος και Ενέργειας, ΤΑΜΕΙΟ ΑΝΑΚΑΜΨΗΣ και ΑΝΘΕΚΤΙΚΟΤΗΤΑΣ, Ευρωπαϊκή Ένωση NextGenerationEU (5.444.251 €)

2024 Ψηφιοποίηση συλλογών φυσικής ιστορίας του Μουσείου Φυσικής Ιστορίας

Ψηφιοποίηση συλλογών φυσικής ιστορίας του Μουσείου Φυσικής Ιστορίας Κρήτης του Πανεπιστημίου Κρήτης και Προμήθεια και εγκατάσταση επιστημονικού εξοπλισμού για την ψηφιοποίηση συλλογών φυσικής ιστορίας στο πλαίσιο του έργου
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 2024 - 2025
Φορέας Χρηματοδότησης: Υπουργείο Περιβάλλοντος και Ενέργειας, Ταμείο Ανάκαμψης και Ανθεκτικότητας, Ευρωπαϊκή Ένωση NextGenerationEU (5.724.425,86€ (2.594.391,56€ για το Πανεπιστήμιο Κρήτης) )

2024 Συλλογή δειγμάτων, απομόνωση και αλληλούχηση

Συλλογή δειγμάτων, απομόνωση και αλληλούχηση, κατάθεσή τους σε δημόσια προσβάσιμα αρχεία δεδομένων και ανάλυση των παραγόμενων γενετικών δεδομένων (αλληλουχίες DNA) για ασπόνδυλα στο πλαίσιο του έργου STRENGTHENING COMPUTATIONAL BIODIVERSITY RESEARCH IN GREECE (ERA Chairs - HORIZON-WIDERA-2022-TALENTS-01-01), EU Funding
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 01/07/2024 - 30/06/2026
Φορέας Χρηματοδότησης: ΙΠ-ΙΤΕ(25.000 €)

2024 Πληθυσμιακή γενωμική μελέτη του κινδυνευόντος

Πληθυσμιακή γενωμική μελέτη του κινδυνευόντος σπόγγου Spongia officinalis
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 16/08/2024 - 15/04/2027
Φορέας Χρηματοδότησης: Ελληνικό Ίδρυμα Έρευνας και Καινοτομίας (ΕΛΙΔΕΚ) (28.800,00 €)

2024 The inquiry of Cretan endemism patterns and its application in the biodiversity conservation

The inquiry of Cretan endemism patterns and its application in the biodiversity conservation, using genomic, morphological and environmental data in chosen Ar-thropods species.
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 01/01/2024 - 31/12/2025
Φορέας Χρηματοδότησης: Επιτροπή Ερευνών Πανεπιστημίου Κρήτης (17.800 €)

2024 THe Genomics of the CrEtan population through hiStory and timE, shaping inflammation and immUne homeoStasis

THESEUS: Γονιδιωματική του Κρητικού πληθυσμού στο χώρο και το χρόνο και η επίδραση στη Φυσιολογική Ανοσολογική Απάντηση
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 2024 - 2025
Φορέας Χρηματοδότησης: Ελληνικό Ίδρυμα Έρευνας και Καινοτομίας (ΕΛΙΔΕΚ) (399.987,00 €)

2023_Η γενωμική ποικιλότητα του Gypaetus barbatus

Η γενωμική ποικιλότητα του Gypaetus barbatus και οι επιπτώσεις της κλιματικής αλλαγής
P.I: Μιχάλης Προμπονάς, Νίκος Πουλακάκης
Duration: 2023 - 2024
Funding: Ιδιωτικοί φορείς (97.232,00 €)

2023_Assessing the conservation status of two stenoendemic Mygalomorph spiders in Crete

Assessing the conservation status of two stenoendemic Mygalomorph spiders in Crete using ecological and molecular evidence
P.I: Μαρία Αλεξίου-Χατζάκη
Duration: 2023 - 2024
Funding: ΕΛΙΔΕΚ (10.000,00 €)

2023 Ψηλά βουνά, ρηχά νερά: οι επιπτώσεις της κλιματικής αλλαγής σε οργανισμούς που ζουν σε «ακραία» και ευαίσθητα οικοσυστήματα

Ψηλά βουνά, ρηχά νερά: οι επιπτώσεις της κλιματικής αλλαγής σε οργανισμούς που ζουν σε «ακραία» και ευαίσθητα οικοσυστήματα
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 1/6/2023 - 1/5/2025
Φορέας χρηματοδότησης: Πράσινο Ταμείο (199.934,89 €)

2023 Κατανεμημένο σύστημα μετάβασης επιστημονικών συλλογών στο έργο ERIC – DiSSCo Transition

Κατανεμημένο σύστημα μετάβασης επιστημονικών συλλογών στο έργο ERIC - DiSSCo Transition
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Πέτρος Λυμπεράκης
Διάρκεια: 1/12/2023 - 31/5/2024
Φορέας χρηματοδότησης: Ευρωπαϊκή Επιτροπή / HORIZON 2020 (6.622,50 €)

2023 Εκτίμηση πληθυσμού και μέτρων προστασίας του Κρητικού Αγριόγατου (Felis silvestris cretensis)

Εκτίμηση πληθυσμού και μέτρων προστασίας του Κρητικού Αγριόγατου (Felis silvestris cretensis)
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Πέτρος Λυμπεράκης
Διάρκεια: 18/7/2023 - 15/3/2024
Φορέας χρηματοδότησης: Οργανισμός Φυσικού Περιβάλλοντος και Κλιματικής Αλλαγής (Ο.ΦΥ.ΠΕ.Κ.Α.) (65.000,00 €)

2022 Πιστοποίηση πεσόντων 2ου παγκοσμίου πολέμου στο χωριό Άδελε του Ρεθύμνου

Πιστοποίηση πεσόντων 2ου παγκοσμίου πολέμου στο χωριό Άδελε του Ρεθύμνου
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 2022 - 2024
Φορέας χρηματοδότησης: Ιδιωτικός Φορέας (17.000,00€)

2022 Spectroscopic Screening of Ancient Dental Remains for Optimized Archaeogenetic Analysis (Spectra-Gen)

Φασματοσκοπικός Έλεγχος Αρχαίων Οδοντικών Υπολειμμάτων για βελτιστοποίηση της Αρχαιογενετικής Ανάλυσης (Spectra-Gen).
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 2022 - 2024
Φορέας χρηματοδότησης: Θεόδωρος Παπάζογλου -ΙΤΕ Synergy (80.000,00€)

2022 Biodiversity Genomics Europe (BGE). HORIZON EUROPE, Type HORIZON-RIA. Coordinator: NATURALIS (Netherlands)

Γονιδιωματική της Βιοποικιλότητας της Ευρώπης. Coordinator: NATURALIS (Netherlands)
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 18/10/2022 - 28/2/2026
Φορέας χρηματοδότησης: Ευρωπαϊκή Επιτροπή / Ευρωπαϊκός Εκτελεστικός Οργανισμός Έρευνας (REA) (221.238,75€)

2020 ΟΙΚΟ-ΕΞΕΛΙΚΤΙΚΗ ΔΥΝΑΜΙΚΗ ΣΤΗΝ ΚΥΠΡΟ: ΜΙΑ ΠΟΛΥΟΡΓΑΝΙΣΜΙΚΗ ΠΡΟΣΕΓΓΙΣΗ ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΛΗΘΥΣΜΙΑΚΗ ΔΙΑΦΟΡΟΠΟΙΗΣΗ ΣΕ ΕΝΑ ΑΠΟΜΟΝΩΜΕΝΟ ΝΗΣΙ

Οικο-εξελεκτική δυναμική στην Κύπρο: Μια πολυοργανισμική προσέγγιση για την πληθυσμιακή διαφοροποίηση σε ένα απομονωμένο νησί (EVOCYPR)
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 13/1/2020 - 14/10/2022
Φορέας Χρηματοδότησης: Πανεπιστήμιο της Κύπρου EXCELLENCE/0918/0161 of the Program Excellence Hubs RESTART 2016-2020, Cyprus (34.600,90 €)

2020 Γενετική ταυτοποίηση Κρητικού Αιγάγρου

Γενετική ταυτοποίηση Κρητικού Αίγαγρου (Capra aegagrus cretica)
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 15/6/2020 - 31/12/2021
Φορέας χρηματοδότησης: Φορέας Διαχείρισης Εθνικού Δρυμού Σαμαριάς – Δυτικής Κρήτης, Επιχειρησιακό πρόγραμμα «Κρήτη 2014-2020» (21.571,95 €)

2019 Συνεργασία σε ζητήματα ταυτοποίησης ειδών ορνιθοπανίδας που συμμετείχαν σε περιστατικό πρόσκρουσης σε αεροσκάφη, εντός των υπό διαχείριση από τη Fraport Greece περιφερειακών αεροδρομίων

Συνεργασία σε ζητήματα ταυτοποίησης ειδών ορνιθοπανίδας που συμμετείχαν σε περιστατικό πρόσκρουσης σε αεροσκάφη, εντός των υπό διαχείριση από τη Fraport Greece περιφερειακών αεροδρομίων
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 20/3/2019 - 14/9/2026
Φορέας χρηματοδότησης: FRAPORT ΕΛΛΑΣ Α.Ε. (12.571,39 €)

2019 Δράσεις ενημέρωσης – ευαισθητοποίησης των πολιτών με σκοπό την ανάδειξη και προστασίατων οικοτόπων και της βιοποικιλότητας της Κρήτης στο ΜΦΙΚ 2017ΕΠ00210024

Δράσεις ενημέρωσης - ευαισθητοποίησης των πολιτών με σκοπό την ανάδειξη και προστασία των οικοτόπων και της βιοποικιλότητας της Κρήτης, στο Μουσείο Φυσικής Ιστορίας Κρήτης - Πανεπιστήμιο Κρήτης 2017ΕΠ00210024
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 2019-10/8/2022
Φορέας χρηματοδότησης: Περιφέρεια Κρήτης / ΕΣΠΑ Επιχειρησιακό Πρόγραμμα «Κρήτη 2014 - 2020 και Ευρωπαϊκό Ταμείο Περιφερειακής Ανάπτυξης (ΕΤΠΑ) (974.957,41 €)

2018  Η μελέτη της εξέλιξης σε πραγματικό χρόνο: από τον υβριδισμό στην ειδογένεση)

Η μελέτη της εξέλιξης σε πραγματικό χρόνο: από τον υβριδισμό στην ειδογένεση
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 15/6/2018 - 31/3/2020
Φορέας Χρηματοδότησης: Ελληνική Δημοκρατία, Υπουργείο Ανάπτυξης και Επενδύσεων - Γενική Γρ. Δημοσίων Επενδύσεων και ΕΣΠΑ 2014-2020 (62.650,00€)

2017 Μικροθηλαστικά της Ελλάδας: Επισκόπηση κατανομών και οικολογικών προτιμήσεων με τη χρήση γεωγραφικών συστημάτων πληροφοριών και ανάλυση εμεσμάτων Tyto alba.

Μικροθηλαστικά της Ελλάδας: Επισκόπηση κατανομών και οικολογικών προτιμήσεων με τη χρήση γεωγραφικών συστημάτων πληροφοριών και ανάλυση εμεσμάτων Tyto alba.
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 1/8/2017 - 30/11/2019
Φορέας Χρηματοδότησης: Ελληνικό Ίδρυμα Έρευνας και Καινοτομίας (ΕΛΙΔΕΚ) (29.700,00€)

2014 Η προσθήκη περισσότερης οικολογίας και γενετικής στην κατανόηση της βιολογικής ποιικιλότητας. Ο ρόλος των νησιών ως φυσικά εργαστήρια

Η προσθήκη περισσότερης οικολογίας και γενετικής στην κατανόηση της βιολογικής ποικιλότητας. Ο ρόλος των νησιών ως φυσικά εργαστήρια
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια:
18/2/2014 - 31/10/2015
Φορέας Χρηματοδότησης:
ΕΣΠΑ-ΓΓΕΤ Ε.Π. Εκπαίδευση και Δια Βίου Μάθηση, Δράση ΑΡΙΣΤΕΙΑ ΙΙ. (395.000,00 €)

2013 Επικαιροποίηση και παροχή ειδικά επεξεργασμένων δεδομένων για την οικολογική (βιολογική) κατάσταση σύμφωνα με τις προδιαγραφές της Οδηγίας 2000/60/ΕΚ για τα Νερά των εσωτερικών επιφανειακών και μεταβατικών υδατικών συστημάτων του Υδατικού Διαμερίσματος Κρήτης στο πλαίσιο της κατάρτισης Σχεδίων Διαχείρισης των λεκανών απορροής ποταμών και υδατικών διαμερισμάτων Κρήτης και Νήσων Αιγαίου

Επικαιροποίηση και παροχή ειδικά επεξεργασμένων δεδομένων για την οικολογική (βιολογική) κατάσταση σύμφωνα με τις προδιαγραφές της Οδηγίας 2000/60/ΕΚ για τα Νερά των εσωτερικών επιφανειακών και μεταβατικών υδατικών συστημάτων του Υδατικού Διαμερίσματος Κρήτης στο πλαίσιο της κατάρτισης Σχεδίων Διαχείρισης των λεκανών απορροής ποταμών και υδατικών διαμερισμάτων Κρήτης και Νήσων Αιγαίου
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 19/4/2013 - 31/12/2016
Φορέας Χρηματοδότησης: Υπουργείο Περιβάλλοντος, Ενέργειας και Κλιματικής Αλλαγής (16.634,12 €)

2012 Παρακολούθηση αμφιβίων, ερπετών, ασπόνδυλων και χειρόπτερων της προστατευόμενης περιοχής Καρπάθου – Σαρίας.

Παρακολούθηση αμφιβίων, ερπετών, ασπόνδυλων και χειρόπτερων της προστατευόμενης περιοχής Καρπάθου – Σαρίας.
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 1/9/2012 - 31/12/2016
Φορέας Χρηματοδότησης: ΟΙΚΟΜ Μελετητική Περιβάλλοντος ΕΠΕ (28.119,63 €)

2012 Additional work on the design of the reservoir on the plateau of Omalos, Chania, and the evaluation of the environmental impact of its construction ΚΑΕ80802

Συμπληρωματικές εργασίες διαστασιολόγησης της λιμνοδεξαμενής στο οροπέδιο του Ομαλού, Χανίων, καθώς και διερεύνησης των περιβαλλοντικών επιπτώσεων από την κατασκευή της - ΚΑΕ80802
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 2012 - 2012
Φορέας Χρηματοδότησης: Φορέας εσωτερικού (15.000,00€)

2011 Πανιδική και Χλωριδική Μελέτη της Περιοχής “Βιτσιλιά” Δήμου Σητείας

Πανιδική και Χλωριδική Μελέτη της Περιοχής "Βιτσιλιά" Δήμου Σητείας
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 1/8/2011 - 31/1/2012
Φορέας Χρηματοδότησης: Φορέας εσωτερικού (14.145,00 €)

2011 Διερεύνηση των φυλογενετικών διεργασιών στις σαύρες του γένους Apathya

Διερεύνηση των φυλογενετικών διεργασιών στις σαύρες του γένους Apathya Mehely, 1907: το μιτοχονδριακό DNA και η χρήση του ως συστηματικός χαρακτήρας
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια:
11/2/2011 - 10/2/2012
Φορέας χρηματοδότησης: ΕΠΙΤΡΟΠΗ ΕΡΕΥΝΩΝ/ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΚΡΗΤΗΣ (2.000,00 €)

2010 Testing Species Boundarios & Phylogeography of the Genus Mesalina in Mediterranean Basin

Έλεγχος των ορίων των ειδών και φυλογεωγραφία του γένους Mesalina (Sauria: Lacertidae) στη λεκάνη της Μεσογείου
Επιστημονικός Υπεύθυνος: Νίκος Πουλακάκης
Διάρκεια: 1/9/2010 - 31/10/2011
Φορέας Χρηματοδότησης: Επιτροπή Ερευνών/Πανεπιστήμιο Κρήτης (12.589,00 €)

Επιστημονικά Άρθρα

Filter

2025_Whole-genome sequencing confirms multiple species of Galapagos giant

Gaughran, S.J., Gray, R., Menna Jones, M., Fusco, N., Ochoa, A., Miller, J.M., Poulakakis, N., de Queiroz, K., Caccone, A., Jensen, E.L. (2025) Whole-genome sequencing confirms multiple species of Galapagos giant tortoises. Evolution Letters, 79(2), 296–308.

2025_Unravelling the thread of Podarcis omics; insights into the genome and transcriptome of the Cretan wall lizard.

Stratakis, M., Ioannidis, P., Bista, Ι., Absolon, D., Eagles, W., McCarthy, S., Denton, A., Lymberakis, P., Poulakakis, N. (2025) Unravelling the thread of Podarcis omics; insights into the genome and transcriptome of the Cretan wall lizard. Genes & Genomics,

2025_Read Length Dominates Phylogenetic Placement Accuracy of Ancient DNA Reads

Bettisworth, B., Psonis, N., Poulakakis, N., Pavlidis, P., Stamatakis, A. (2025) Read Length Dominates Phylogenetic Placement Accuracy of Ancient DNA Reads. Molecular Biology and Evolution, 42(2), 1-10.

2025_Podarcis siculus (Rafinesque, 1810) as a modern Lernaean Hydra: the emergence of a new invasive population in Crete

Pantagaki, C.F., Spaneli, V., Fisher, R.N., Alexandrakis, G., Poulakakis, N., Lymberakis, P. (2025) Podarcis siculus (Rafinesque, 1810) as a modern Lernaean Hydra: the emergence of a new invasive population in Crete and its implications for bridgehead invasions in the Greek Islands. Herpetology Notes, 18, 389-397.

2025_ERGA-BGE reference genome of Hanak’s bat Pipistrellus

Georgakakis, P., Karakasi, D., Lymberakis, P., Papadimitrakis, M., Stratakis, M., Bitzilekis, E., Poulakakis, N., Böhne, A., Monteiro. R., Fernández, R., Escudero, N., Genoscope Sequencing Team, Moussy. A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Mangenot, S., Belser, C., Wincker, P., Oliveira, P.H., Aury, J.-M., Haggerty, L., Sinha, S., Martin, F., Bortoluzzi, C. (2025) ERGA-BGE reference genome of Hanak's bat (Pipistrellus hanaki), an IUCN Vulnerable species restricted to forest-like biotopes. Open Res Europe, 5:298.

2025_ERGA-BGE genome of Dendarus foraminosus: an IUCN Least

Bolanakis, I., Karakasi, D., M., Trichas, A., Böhne, A., Monteiro. R., Fernández, R., Escudero, N., Bitzilekis, E., Stratakis, Lymberakis, P., Poulakakis, N., Genoscope Sequencing Team, Moussy. A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Duprat, S., Téodori, E., Wincker, P., Oliveira, P.H., Aury, J.-M., Haggerty, L., Sinha, S., Martin, F., Bortoluzzi, C. (2025) ERGA-BGE genome of Dendarus foraminosus: an IUCN Least Concern darkling beetle endemic to Crete (Greece) (version 2; peer review: 3 approved, 1 approved with reservations). Open Res Europe, 5:173.

2025_ERGA-BGE genome of Dailognatha quadricollis, an East Mediterranean darkling beetle

Bolanakis, G., Karakasi, D., Bitzilekis, E., Stratakis, M., Trichas, A., Lymberakis, P., Poulakakis, N., Böhne, A., Monteiro, R., Fernández, R., Escudero, N., Team, G. S., Moussy, A., Cruaud, C., Labadie, K., Demirdjian, L., Téodori, E., Wincker, P., Oliveira, P. H., & Jean-Marc Aury. (2025) ERGA-BGE genome of Dailognatha quadricollis, an East Mediterranean darkling beetle. (version 1; peer review: 1 approved, 1 approved with reservations). Open Res Europe, 5:225.

2025_Comparative Phylogeography of Four Endemic Lizards Within an Isolated Oceanic Island.

Antoniou, T., Dimitriou, A.C., Karameta, E., Antoniou, A., Poulakakis, N., Sfenthourakis, S. (2025) Comparative Phylogeography of Four Endemic Lizards Within an Isolated Oceanic Island. Molecular Phylogenetics and Evolution, 205. 108295

2025_A pattern of hybridisation and population genetic structure of two water frog species (Ranidae, Amphibia) in the southwestern Balkans

Papežík, P., Aschengeschwandtnerová, S., Benovics, M., Dedukh, D., Doležálková-Kaštánková, M., Choleva, L., Javorčík, A., Lymberakis, P., Papežíková, S., Poulakakis, N., Sarı, İ., Šanda, R., Vukić, J., & Mikulíček, P. (2025) A pattern of hybridisation and population genetic structure of two water frog species (Ranidae, Amphibia) in the southwestern Balkans Zoologica Scripta, 54: 487–508.

2025 On the path to extinction

Maroulis, l., Poulakakis, N., Proios, K., Karakasi, D., Triantis, K.A., Mylonas, M., Vardinoyannis, K. (2025) On the path to extinction: Helix godetiana Kobelt, 1878, the only threatened Helix species in Greece. Nature Conservation 58: 1–10

Βιβλία - Κεφάλαια σε Βιβλία

Filter

2025_Ολοκληρωμένες Αρχές Ζωολογίας

Hickman, Jr. C.P., Keen, S.L., Eisenhour, D.J., Larson, A., I'Anson, H. (2025) Ολοκληρωμένες Αρχές Ζωολογίας, 19η Έκδοση. (Πουλακάκης,Ν., και ομάδα μεταφραστών, Βουλτσιάδου,Ε., Επιμ. Ελλ. Έκδ.) UTOPIA

2020 Phylogeography of the Fauna of Greece (in greek).

Poulakakis, N. (2020) Phylogeography of the Fauna of Greece (in greek). In P. Pafilis (Eds.), The fauna of Greece: Biology and management of wildlife. Broken Hill Publishers Ltd. Nicosia, Cyrpus.

2018 The Aegean Archipelago: From Zoogeography to Phylogeography.

Poulakakis, N., Parmakelis, A. (2018) The Aegean Archipelago: From Zoogeography to Phylogeography. In S. Sfenthourakis, P. Pafilis, A. Parmakelis, N. Poulakakis & K. A Triantis (Eds.), Biogeography and Biodiversity of the Aegean. In honour of Prof. Moysis Mylonas. (pp. 269-278). Nicosia: Cyprus, Broken Hill Publishers Ltd

2015 Abstracts of the International Congress on the Zoogeography and Ecology of Greece and Adjacent Regions, 13th ICZEGAR, 7-11 October 2015, Irakleio, Crete, Greece

Poulakakis N., Antoniou, A., Karameta, E., Psonis, N., Vardinoyannis K. (Eds) (2015) Abstracts of the International Congress on the Zoogeography and Ecology of Greece and Adjacent Regions, 13th ICZEGAR, 7-11 October 2015, Irakleio, Crete, Greece (pp.203.) Hellenic Zoological Society

2009 Abstracts of the International Congress on the Zoogeography, Ecology and Evolution of Eastern Mediterranean, 11th ICZEGAR, 21-25 September, Herakleion, Crete, Greece. 2009.

Poulakakis, N., Vardinoyannis, K. (Eds.) (2009) Abstracts of the International Congress on the Zoogeography, Ecology and Evolution of Eastern Mediterranean, 11th ICZEGAR, 21-25 September, Herakleion, Crete, Greece, (pp.218.) Hellenic Zoological Society ISBN: 978-960-85298-7-8

2018 Biogeography and Biodiversity of the Aegean.

Sfenthourakis, S., Pafilis, P., Parmakelis, A., Poulakakis, N., Triantis, K. (Eds.). (2018) Biogeography and Biodiversity of the Aegean. In honour of Prof. Moysis Mylonas. (pp.299). Nicosia: Cyprus, Broken Hill Publishers Ltd. ISBN: 978-9925-563-78-4.

2018 Amphibians and Reptiles of the Aegean Sea.

Lymberakis, P., Pafilis, P., Poulakakis, N., Sotiropoulos, K., Valakos, E. D. (2018) Amphibians and Reptiles of the Aegean Sea. In S. Sfenthourakis, P. Pafilis, A. Parmakelis, N. Poulakakis & K. A. Triantis (Eds.), Biogeography and Biodiversity of the Aegean. In honour of Prof. Moysis Mylonas. (pp. 169-190). Nicosia: Cyprus, Broken Hill Publishers Ltd

Ανακοινώσεις σε Συνέδρια

Filter

2025_The genomic landscape of the Cretan population

Papadadonakis, S., Ioannidis, P., Psonis, N., Vassou, D., Koursioti, S., Gonidakis, G., Tabakaki, E., Stamatakis, A., Poulakakis, N., Pavlidis, P. (2025) "The genomic landscape of the Cretan population". -International Conference on Human Genetics, October 16-17 2025, Rome, Italy.

2025_Shrewing around: Notes on sampling, presence, distribution and ecology of the family Soricidae in Greece.

Kiamos, N., Lymberakis, P., Stratakis, M., Bitzilekis, E., Papadovasilakis, Z., Poulakakis, N. (2025) Shrewing around: Notes on sampling, presence, distribution and ecology of the family Soricidae in Greece. -Oral Presentation- IX European Congress of Mammalogy - ECM9, 31 March – 4 April, 2025, Patra, Greece.

2025_Reassessing the taxonomic validity of Aegaeobuthus gallianoi (Arachnida: Scorpiones)

Tampouratzi, D., Stathi, I., Poulakakis, N. (2025) Reassessing the taxonomic validity of Aegaeobuthus gallianoi (Arachnida: Scorpiones) as an endemic scorpion species of Crete. -Poster Presentation- 16th International Congress on the Zoogeography and Ecology of Greece and Adjacent Regions (16th ICZEGAR), 3-6 July 2025, Athens, Greece.

2025_Move, Adapt, or Die: The genomic diversity of Gypaetus barbatus

Koursioti, S., Psonis, N., Vassou, D., Xirouchakis, S., Probonas, M., Stamatakis, A., Pavlidis, P., Poulakakis, N. (2025) Move, Adapt, or Die: The genomic diversity of Gypaetus barbatus and the impacts of climate change. 16th International Congress on the Zoogeography and Ecology of Greece and Adjacent Regions (16th ICZEGAR), 3-6 July 2025, Athens, Greece.

2025_Investigatinge the validity of the current taxonomy of the Blue-throated keeled lizard

Morfesis, K., Strachinis, I., Poulakakis, N., Triantafyllidis, A., Sagonas, K. (2025) Investigatinge the validity of the current taxonomy of the Blue-throated keeled lizard (Algyroides nigropunctatus) using integrative genomic and behavioral approaches. -16th International Congress on the Zoogeography and Ecology of Greece and Adjacent Regions, 3-6 July 2025, Athens, Greece.

2025_High quality human genome assemblies from the island of Crete (Greece) form the foundation for downstream genomics studies”

Ioannidis, P., Papadadonakis, S., Vassou, D., Tabakaki, E., Koursioti, S., Gonidakis, G., Stamatakis, A., Poulakakis, N., Psonis, N., Pavlidis, P. (2025) "High quality human genome assemblies from the island of Crete (Greece) form the foundation for downstream genomics studies". -International Conference on Human Genetics, October 16-17 2025, Rome, Italy.

2025_Genomic Study of the Evolutionary History of the Greek Hunting Dog Breeds.

Tosiou, E., Dimopoulos, E. A., Karaiskou, N., Gkagkavouzis, K., Tsartsianidou, V., Venetsani, S., Kiousis, D., Chatzinikos, E., Parker, H. G., Ostrander, E. A., Frantz, L. A. F., Poulakakis, N., Larson, G., & Triantafyllidis, A. (2025) Genomic Study of the Evolutionary History of the Greek Hunting Dog Breeds. 44th Annual Conference of Hellenic Society for Biological Sciences, 22-24 May 2025,  Ioannina, Greece.

2025_From genome to traits: A holistic approach to adaptation of an endemic lizard.

Stratakis, M., Antoniou, A., Ioannidis, P., Bitzilekis, E., Kiamos, N., Lymberakis, P., Poulakakis, N. (2025) From genome to traits: A holistic approach to adaptation of an endemic lizard. -Oral presentation- 12th Conference of the Hellenic Ecological Society (HELECOS 12), October 1–4, 2025, Athens, Greece.

2025_Conservation genomics of the bath sponge Spongia officinalis:

Sarropoulou, X., Vernadou, E., Skouradakis, G., Tsigenopoulos, C.S., Poulakakis, N., Manousaki, T., Dailianis, T.  (2025) Conservation genomics of the bath sponge Spongia officinalis: expanding insights into population diversity and adaptive potential. -12th World Sponge ConferenceVila do Conde, 09-13 September 2025, Portugal.

2025_Bones, Grave Goods, and Mortuary Practices: A Multidisciplinary Osteoarchaeological Study of

Konstantopoulou, M.V., Pappa I., Staikou, V., Psonis, N., Vassou, D., Tabakaki, E., Poulakakis, N., Iliopoulos, G. (2025) "Bones, Grave Goods, and Mortuary Practices: A Multidisciplinary Osteoarchaeological Study of a Hellenistic Infant Burial in Lefkada". -9th Symposium of the Hellenic Archaeometric Society, 05-09 November 2025, Patra, Greece.

 .