Herbarium.

Το herbarium του Τμήματος Βοτανικής περιλαμβάνει τις εξής συλλογές:

Συλλογές Ανωτέρων Φυτών

1. Συλλογή φυτών της Κρήτης, με περισσότερα από 1050 είδη φυτών, με στόχο να συμπεριλάβει στο άμεσο μέλλον και τα 1800 είδη που υπάρχουν στην Κρήτη.
2. Συλλογή φυτών της υπόλοιπης Ελλάδας.
3. Συλλογή φυτών της Κύπρου με 155-περίπου είδη.
4. Συλλογές φυτών από τις ερευνητικές εξορμήσεις του Μουσείου Φυσικής Ιστορίας Κρήτης στην Τυνησία, στο Μαρόκο, στη Συρία, Ιορδανία και Αίγυπτο.

Συλλογές Κρυπτόγαμων

1. Συλλογή Βρυόφυτων της Κρήτης με περισσότερα από 70 είδη.
2. Συλλογή Βρυόφυτων της υπόλοιπης Ελλάδας.
3. Συλλογή Βρυόφυτων άλλων χωρών της Ευρώπης.
4. Συλλογή Λειχήνων